Es un colegio católico franciscano que desea brindar una educación integral humanista abarcando todo el misterio de la persona en los niveles de Preescolar, Primaria, Secundaria y Bachillerato. Con 80 años de servicio y calidad educativa. Atendido por los frailes de la Orden de Hermanos Menores (Franciscanos).
El Instituto Margil surgió en la ciudad de Aguascalientes en 1940, fue fundado por Fr. Fernando Cisneros, de
la Orden de Frailes Menores. En sus inicios, el colegio funcionó como escuela parroquial que ofrecía
instrucción religiosa y nociones de lecto-escritura.
Ésta inició como actividad social de los Frailes del Templo de San Diego. En 1945 se adquirió el edificio de
la calle Álvaro Obregón #211, en la zona centro, donde se encontraban las secciones de preescolar y
primaria. El P. Fr. Fernando Cisneros fungía como director técnico y era Guardián del Convento de San Diego.
Como directora oficial ante la Secretaría de Educación Pública, se nombró a la Maestra Ma. del Carmen
Ibarra.
En 1946 se nombra "Colegio Lope de Vega", en honor al escritor español que se convirtió franciscano, pero el
nombre no pareció adecuado y el Colegio fue rebautizado "MARGIL DE JESÚS" debido a que fue el evangelizador
de la zona de Aguascalientes.
Éste Colegio se mantuvo durante un tiempo con las limosnas del templo de San Diego y con la cooperación de
los padres de familia. Las maestras que impartían las clases eran seglares franciscanas. Se brindaban clases
sólo a varones. Con el tiempo se tomó la decisión de que fuera mixto y ofreció educación secundaria para
jóvenes en la misma modalidad.
A fines de 1949, con referencia al año escolar, el Padre Gil López deja la dirección en manos del P. Fr.
Miguel González, OFM., colaborando con él, como directora académica, la Mtra. y Hna. María de los Ángeles
Ibarra. Fray Miguel fue director hasta 1975, con algunos intervalos, ya que fue enviado a Zapopan, Jal.,
como maestro de novicios. Fue sustituido por el P. Fr. Pedro Ortiz, OFM., quien realizó modificaciones al
colegio, expandiendo los salones en la planta baja, construyó el segundo piso y todo lo que ahora es sección
primaria.
En 1955 se fundó la sección Secundaria. Estuvieron directamente involucradas las Religiosas de Nuestra
Señora del Refugio. Ésta sección se incorporó a la Universidad Autónoma de Aguascalientes el 19 de
septiembre de 1972, pero por condición educativa, se incorporó al Instituto de Educación de Aguascalientes a
partir del año 2003.
La fundación de la Preparatoria, tanto matutina como vespertina, se realizó en el año de 1971 por el P. Fr.
Miguel González, en el edificio de Álvaro Obregón. El turno matutino inició con diez alumnos y el vespertino
con sesenta. Tomó la secretaría de los dos turnos la Maestra Margarita Castro, quien venía prestando sus
servicios desde el año de 1961.
En el año 1972 comenzó a funcionar la preparatoria en el edificio de la calle Margil de Jesús #199, en el
Fraccionamiento Circunvalación Norte. La primera piedra de este edificio se colocó el día 20 de diciembre de
1964, siendo el director el P. Fr. Miguel González. Ésta sección se incorporó a la Universidad Autónoma de
Aguascalientes a partir del 10 de marzo de 1972.
En 1975 llegó como Director General el P. Fr. Mariano Cárdenas Ávila, OFM., quien entregó el cargo al P. Fr.
Daniel Córdova Ibarra, OFM., en septiembre de 1987.
El primero de diciembre de 1990 recibió la Dirección el P. Fr. Manuel Rivera Robles, OFM.
En agosto de 2001 asume la Dirección General el Lic. Fr. Antonio Galindo Carreón, OFM. El 28 de octubre de
2005 se inauguraron las nuevas instalaciones de las secciones de preescolar y primaria en la calle Cedro
#436 en el Fraccionamiento Circunvalación Norte e inició sus actividades a partir del 9 de enero de 2006,
fungiendo como Director el Lic. Fr. J. Félix Cervantes López.
Las secciones de Secundaria y Bachillerato son únicamente en el turno Matutino. La planta física, además de
sus aulas, el Instituto cuenta con un laboratorio de ciencias, salón de danza y música, biblioteca,
departamento de asesoría psicopedagógica en ambas secciones, cafetería, canchas deportivas (básquetbol,
voleibol y fútbol rápido) y un moderno laboratorio de computación.
A partir de agosto de 2008, es atendida por tres sacerdotes franciscanos siendo el director general P. Fr.
Francisco Javier Ley Montijo, P. Fr. Javier Dávila Acevedo, director de secundaria y bachillerato y P. Fr.
Fernando Tovar Cano, administrador y responsable de la pastoral de los alumnos, formación catequética y
valores.
En 2017, el Padre Fray César Hernández, OFM. toma la dirección general de las instalaciones del colegio
junto al Padre Fray Enrique Romo, OFM. como sub director general, asimismo, Fray Benito Rueda, OFM. y Fray
Jesús de Ávila, OFM. Durante este periodo se inicia la construcción del auditorio del colegio, se amplía el
número de salones en la sección primaria y se inicia el proceso de acreditación en la calidad educativa
(SACE) ante la Confederación Nacional de Escuelas Para la Educación Cticulares, logrando la misma en el año
2021.
En este mismo año, se renueva la fraternidad educativa tomando la dirección general el Padre Fray Raúl
Martínez, OFM., y se incorpora a la misma Fray Heriberto Ruvalcaba, OFM. quienes actualmente permanecen al
frente de nuestra institución.